Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms