Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCDC88CQ9P219 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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