Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG3Q9NT62 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms