Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4BQ9NPR2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4BQ9NPR2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms