Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms