Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIM55Q9BYV6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM55Q9BYV6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms