Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTRT3Q9BYD9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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