Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA1CQ9BQE3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms