Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms