Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LTV1Q96GA3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms