Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms