Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms