Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2E3Q969T4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms