Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRG4Q92954 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms