Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP2Q8WWK9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms