Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms