Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTBP4Q8N2S1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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