Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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