Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC71Q8IV32 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC71Q8IV32 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms