Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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