Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2AFVQ71UI9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2AFVQ71UI9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms