Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms