Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms