Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SFT2D3Q587I9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFT2D3Q587I9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms