Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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RTN1Q16799 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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