Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDB1Q16531 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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