Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK5Q16478 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK5Q16478 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK5Q16478 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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GRIK5Q16478 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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GRIK5Q16478 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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