Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYTH1Q15438 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms