Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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