Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRD3Q15059 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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