Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
R3HDM1Q15032 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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