Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAPSQ13938 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms