Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLN3Q13286 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN3Q13286 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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