Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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CALCOCO2Q13137 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CALCOCO2Q13137 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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