Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP1Q12981 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms