Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMA1Q12791 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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