Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXO1Q12778 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXO1Q12778 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXO1Q12778 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXO1Q12778 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXO1Q12778 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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