Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAAP100Q0VG06 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms