Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FAM27E3Q08E93 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms