Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
POLEQ07864 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
POLEQ07864 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
POLEQ07864 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
POLEQ07864 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
POLEQ07864 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
POLEQ07864 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms