Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms