Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms