Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms