Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms