Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms