Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA2D1P54289 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms