Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETV4P43268 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETV4P43268 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETV4P43268 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms