Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTGER3P43115 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms