Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms