Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA6P31267 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms